第三种编辑人类基因组的有力工具Cas12b

  2019年1月23日,张锋教授在期刊报告:第三个可以编辑人类细胞基因组的CRISPR-Cas系统:CRISPR-Cas12b。

  我们已经熟悉的Cas9,这套基因编辑工具得到广泛应用,不过Cas9也有限制,比如切割非靶点序列的脱靶效应。科学家们不断扩大范围,寻找新秀,例如Cas12a。

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▲2017年1月,张锋教授与NIH两位科学家在《Cell》发文,详细归纳了2类CRISPR系统的特点和作用机制

  最后发现,Cas12b蛋白比Cas9和Cas12a更小,更容易实现细胞间递送。性能最佳的Cas12b来自一种嗜酸耐热菌,作为DNA裂解酶的最佳活性需要高达48℃。但是哺乳动物细胞内,达不到这种温度要求,酶活性就不能发挥。

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▲Cas9、Cas12a、Cas12b三种核酸酶的基因序列模式图和蛋白质结构示意图

  根据同源序列比对,研究开始寻找Cas12b蛋白家族常温的成员,从外村尚芽孢杆菌的细菌中,鉴定出了在37℃能保持核酸酶活性的BhCas12b。并且,研究人员还通过调整指导RNA(sgRNA)的结构,让Cas12b的效率得到大幅提升。

  可是,体外切割实验发现,原始结构的Cas12b在DNA双链断裂时,会切割非靶标单链,并且温度越低,错误越多。研究者对Cas12b进行了工程改造,解决这个问题,通过4个点突变,得到了重新设计的新Cas12b,让酶的活性位点更容易和DNA靶序列接近。

  经过重新设计的Cas12b,编辑效率不低于Cas9和Cas12a,将足以在成为又一款在体编辑人类基因组的有力工具。

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▲GUIDE-seq分析显示,重新设计的Cas12b没有出现Cas9那样的脱靶效应

  全基因组范围内的脱靶效应检测结果表明,相比常用的Cas9,Cas12b导致的错误插入缺失都要少得多,脱靶性显著降低。

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